Bestyrelsen består af otte medlemmer. Folkekirkens Arbejdsmiljøråd udpeger seks medlemmer til FAR’s bestyrelse. Kirkeministeren udpeger en repræsentant for Kirkeministeriet og udpeger en repræsentant med en arbejdsmiljøfaglig ekspertise efter indstilling fra bestyrelsens øvrige medlemmer. Bestyrelsen vælges for en fireårig periode.